ANÁLISE DE BIOINFORMÁTICA PARA CONFECÇÃO DE NOVOS PRIMERS PARA AS VARIANTES VARIANTES RS2285666 E RS4240157 DO GENE ACE2 DO SARS-COV-2
INTRODUÇÃO: A pandemia da COVID-19, uma crise global causada pelo vírus SARS-CoV-2, que foi detectada pela primeira vez na cidade de Wuhan, na China, em dezembro de 2019. Desde a sua descoberta foi estendida pelo mundo, afetando e matando milhões de pessoas. O material genético do vírus SARS-CoV-2 é o RNA, sendo composto por cerca de 30.000 nucleotídeos e é organizado em vários genes que codificam as proteínas necessárias para sua reaplicação, invasão celular e evasão do sistema imunológico. Esse vírus tem uma proteína importante para seu meio de infecção, se chama proteína S, ela é composta por duas subunidades, a S1 e a S2. A S1 é responsável pela interação do vírus com a superfície celular; enquanto a S2 promove a fusão do envelope do vírus com a membrana plasmática da célula. Quando o domínio RBD da subunidade S1 interage com o receptor da ECA-2 da célula-alvo, acontece a infecção viral. OBJETIVOS: Analisar através de ferramentas de bioinformática, primers para as variantes rs2285666 e rs4240157 do gene ACE2 do SARS-CoV-2. MATERIAIS E MÉTODO: O design de primer e identificação de uma enzima de restrição para utilizar a técnica QRT-PCR em conjunto com a RFLP para análise em eletroforese em gel de agarose. RESULTADOS: O desenho dos primers desenvolveu-se em éxons distintos para o primer senso e antisenso. Toda analise foi realizada a partir da plataforma GenBank do NCBI foi realizada a identificação do gene ECA2 e a localização da variantes. CONSIDERAÇÕES FINAIS: O diagnóstico molecular se faz necessário devido sua agilidade e rapidez. Porém o entendimento e desenho de primers específicos e novos estudos sobre a elucidação de processos infecciosos se faz necessário para que métodos moleculares sejam realizados. Neste trabalho, foi elaborado e otimizado um protocolo para a análise das variantes do gene ECA2, para análise em qRT-PCR pelo método RFLP de gestantes infectadas.
PALAVRAS-CHAVE: 1. Variantes ACE2; 2. primer design; 3. SARS-Cov-2; 4. gestantes; 5 QRT-PCR