ANÁLISE DE BIOLOGIA SISTÊMICA EM DADOS DE TRANSCRIPTOMA DE CÉLULAS CEREBRAIS COM MUTAÇÕES NO GENE MECP2

INTRODUÇÃO: A Síndrome de Rett (RTT) é um distúrbio neurológico generalizado e caracterizado por funções cerebrais comprometidas, deficiências de linguagem e aprendizado, movimentos estereotipados de forma repetitiva e regressão do desenvolvimento. Embora as novas tecnologias de sequenciamento (high throughput sequencing technologies) tenham permitido estudar as modificações genéticas em células cerebrais de RTT, não há ainda pesquisas demonstrando de forma extensiva as vias de interação genética e moleculares do transcriptoma de amostras de RTT em comparação com dados controle OBJETIVOS: Modelar e identificar redes de interação molecular e de biologia sistêmica em dados de transcriptoma de células cerebrais de indivíduos com síndrome de Rett portando mutações no gene MECP2 MATERIAIS E MÉTODO: Foram utilizadas diferentes amostras celulares, sendo elas: Lobo Frontal, Interneurônio, NPC (Células Progenitoras Neurais), Astrócito e Neurônio. Todas as células e dados de transcriptoma foram gerados e fornecidos por meio de colaboração com a Universidade da Califórnia San Diego (UCSD, USA). Os dados obtidos foram analisados na PUCPR e foi realizada a análise de expressão gênica com cálculo de significância estatística. Com os valores gerados foi construída uma rede de interação molecular pela ferramenta esyN e análise do enriquecimento de vias de interações pelo software ShinyGO. RESULTADOS: Dentre as cinco amostras do estudo e considerando somente os genes diferencialmente expressos com significância estatística, foi observado vinte genes em comum. Foi realizada a etapa da construção de redes de interação através da ferramenta esyN e resultou em uma rede com interações diretas entre os genes. Além disso, obteve-se uma tabela com o número de genes pertencentes a determinada via e quais foram esses genes. Após a conclusão da análise as vias foram filtradas visando a visualização somente daquelas relacionadas ao cérebro. CONSIDERAÇÕES FINAIS: O uso de ferramentas de Bioinformática e Biologia Sistêmica permitiu a interpretação dos dados de interação e vias e comparação com os fenótipos conhecidos da síndrome. Dessa forma, é possível a construção de uma ponte entre genótipo e fenótipo para melhor visualização e análise do problema.

PALAVRAS-CHAVE: Síndrome de Rett; Interação molecular; Vias metabólicas; gene MECP2.